More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4280 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  76.8 
 
 		 349 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  72.52 
 
 		 314 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  72.88 
 
 		 334 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  71.24 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  61.84 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  61.87 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  59.4 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  52.92 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  49.85 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  52.67 
 
 		 331 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  50.92 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  50.61 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  50.51 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  49.68 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  49.01 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  51.32 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  50.97 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  49.15 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  52.33 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.73 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  47.68 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.1 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.85 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  49.33 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.94 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  44.69 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  48.19 
 
 		 342 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.25 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.78 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  49.33 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.91 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  45.97 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.16 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.27 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.49 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.96 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.86 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.57 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.24 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.57 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.24 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  47.54 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.12 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.44 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  42.68 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.77 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.29 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.77 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.51 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  45.54 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.11 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.34 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.23 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.93 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.3 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  45.08 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.34 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  43.71 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.88 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.89 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.97 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.34 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.97 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.34 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.39 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.22 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.08 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.08 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.33 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  45.24 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.23 
 
 		 344 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.23 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.01 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.12 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.99 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.25 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  46.31 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.38 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.44 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.22 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.19 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  44.22 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  43.28 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  43.69 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>