More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3927 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 329 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  81.46 
 
 		 329 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  71.83 
 
 		 339 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  70.34 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  73.46 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  68.11 
 
 		 335 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  69.72 
 
 		 338 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  65.05 
 
 		 331 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  64.44 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  61.11 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  59.69 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.71 
 
 		 344 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.18 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.37 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.12 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.12 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.41 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.07 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.14 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.37 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.75 
 
 		 360 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.64 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.81 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.73 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  42.14 
 
 		 342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.23 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.66 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.49 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  43.69 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.24 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  42.47 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.8 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.82 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  42.37 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  43.24 
 
 		 334 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  42.52 
 
 		 324 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  40.06 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  42.51 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.07 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  41.67 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  39.81 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  40.37 
 
 		 327 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.88 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  39.32 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.96 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.99 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  40.07 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  42.91 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.83 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.86 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.58 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.58 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.6 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.62 
 
 		 325 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.13 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.77 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.21 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.77 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.45 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.39 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.59 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.06 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.79 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.8 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.39 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.07 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.83 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.93 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.34 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  42.02 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.47 
 
 		 338 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.94 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.74 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.47 
 
 		 304 aa  235  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  40.89 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>