More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5199 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.26 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  45.15 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.83 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.83 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.27 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.91 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.89 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  39.02 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.85 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.07 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.77 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.47 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.2 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  41.49 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.37 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.28 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.53 
 
 		 339 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.02 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.23 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.22 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3599  hypothetical protein  44.07 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373831  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  40.29 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.4 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.3 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.96 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.43 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.27 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.21 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.5 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  40.54 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  41.58 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.23 
 
 		 322 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.02 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.57 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  41.84 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.73 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.55 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  42 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  40.2 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.92 
 
 		 346 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.77 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.07 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.22 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.35 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.91 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.25 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.41 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  39.34 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.09 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.03 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.27 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.64 
 
 		 349 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.88 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.02 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.4 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.93 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  41.5 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  40.2 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.6 
 
 		 328 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  37.7 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.21 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  40.43 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  40.94 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  39 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.16 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.03 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.45 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  44.15 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.53 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.4 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.87 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  39.19 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  40.48 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  38.26 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>