More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3869 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  59.4 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  51.85 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  52.56 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.85 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.92 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.15 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  46.64 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.93 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.2 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.02 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.37 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.31 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.23 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.67 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.82 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.86 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  44.62 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.23 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  44.59 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.27 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  41.77 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.64 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  45 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.12 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  43.22 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.5 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.88 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  44.09 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.07 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.28 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  42.9 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.72 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.58 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.05 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.44 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.96 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  42.52 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.71 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  39.14 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.12 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  41.54 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.56 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.95 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  43.96 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.49 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  40.36 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.27 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.82 
 
 		 349 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.63 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.45 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.26 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.84 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.26 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.62 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.93 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.33 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  42.95 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.09 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.81 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.11 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.19 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.07 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  43.05 
 
 		 361 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.27 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.48 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.08 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.02 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.18 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.93 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40.31 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 329 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>