More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3271 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  79.32 
 
 
339 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  82.66 
 
 
336 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  75.61 
 
 
395 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  75.54 
 
 
335 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  69.72 
 
 
329 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  71.83 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  66.87 
 
 
331 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  66.25 
 
 
331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  57.75 
 
 
330 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  56.49 
 
 
332 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.93 
 
 
344 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.52 
 
 
339 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43 
 
 
330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.62 
 
 
330 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.37 
 
 
332 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.42 
 
 
339 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.34 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 
322 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.07 
 
 
325 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.69 
 
 
329 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.31 
 
 
324 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.83 
 
 
353 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.14 
 
 
327 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.14 
 
 
325 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.75 
 
 
339 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.9 
 
 
333 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.07 
 
 
349 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.62 
 
 
360 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.1 
 
 
323 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.9 
 
 
335 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.82 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.19 
 
 
322 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.91 
 
 
337 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 
331 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.73 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.97 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  43.92 
 
 
319 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.61 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.86 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.43 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  43.61 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.59 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  42.52 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.38 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.21 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.38 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.38 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.28 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.39 
 
 
327 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.52 
 
 
327 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.28 
 
 
328 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.81 
 
 
339 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.95 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.25 
 
 
333 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  39.93 
 
 
337 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.6 
 
 
338 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.27 
 
 
327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.2 
 
 
342 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.72 
 
 
337 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.81 
 
 
323 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.43 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.24 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.73 
 
 
323 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 
304 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  42.67 
 
 
326 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.05 
 
 
328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.86 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.15 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  42.11 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  40.92 
 
 
322 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  40.13 
 
 
332 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.75 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.74 
 
 
331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 
332 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.61 
 
 
345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.87 
 
 
343 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.8 
 
 
325 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.61 
 
 
345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.99 
 
 
356 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.85 
 
 
330 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  40.8 
 
 
324 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 
331 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  42.02 
 
 
327 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.5 
 
 
346 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.61 
 
 
338 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.72 
 
 
325 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.25 
 
 
322 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.98 
 
 
325 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 
335 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.14 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.78 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  40.13 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.72 
 
 
343 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>