More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1578 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  798    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  79.45 
 
 		 339 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  78.29 
 
 		 336 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  78.76 
 
 		 338 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  72.08 
 
 		 329 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  66.18 
 
 		 335 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  72.55 
 
 		 329 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  68.98 
 
 		 331 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  68.65 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  55.93 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  54.13 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  48.34 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.85 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.67 
 
 		 336 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.19 
 
 		 344 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.62 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.76 
 
 		 332 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.07 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.71 
 
 		 349 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.89 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.73 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  42.53 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.73 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  41.64 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.66 
 
 		 329 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.58 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.33 
 
 		 360 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.71 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.11 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.65 
 
 		 327 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  43.62 
 
 		 324 aa  239  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.47 
 
 		 327 aa  239  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.13 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  37.7 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.45 
 
 		 312 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.83 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.07 
 
 		 327 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.22 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.21 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  42.57 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.54 
 
 		 339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.11 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.45 
 
 		 339 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.13 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.4 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.26 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  36.26 
 
 		 698 aa  233  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  38.49 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.78 
 
 		 324 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.76 
 
 		 326 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.06 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 		 328 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  43.1 
 
 		 334 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.54 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.27 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  40.37 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.28 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.12 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.34 
 
 		 322 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.34 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.41 
 
 		 304 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  39.73 
 
 		 318 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.6 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.61 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.75 
 
 		 320 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.63 
 
 		 327 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.13 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  38.72 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.93 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  37.83 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  37.42 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.86 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.23 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.26 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  40.96 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.66 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>