More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0256 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  84.76 
 
 		 328 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.79 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.03 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.96 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.25 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.14 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.08 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.63 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.13 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.14 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.12 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.19 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.19 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.9 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.03 
 
 		 336 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.96 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.79 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.39 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.53 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.07 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.79 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.38 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.42 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.33 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.15 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.67 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.84 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.75 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.59 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.26 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.28 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.42 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  43.25 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.63 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.73 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.55 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.28 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.05 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.33 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.52 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.88 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.03 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.34 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.82 
 
 		 323 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.88 
 
 		 345 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.1 
 
 		 339 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.94 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.9 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43.77 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.38 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.67 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.59 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.35 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  42.64 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.49 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.27 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.63 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.52 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.62 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.63 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  45.36 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.69 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.88 
 
 		 339 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  40.8 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  45.36 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  45.36 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  44.16 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  42.14 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  42.31 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.45 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.86 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  40.96 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  40.92 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.91 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  41.87 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>