More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1635 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  59.27 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  51.67 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  51.79 
 
 		 332 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  53.33 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.68 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.34 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  53.95 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  51.36 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  50.34 
 
 		 327 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  48.86 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  50.98 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  50.98 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50.17 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  51.18 
 
 		 349 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  48.66 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  53.47 
 
 		 334 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  53.62 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.85 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.05 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.38 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.23 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.88 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.81 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.63 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.99 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.97 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  48.05 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.41 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.35 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  49.17 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  47.65 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.08 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.58 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.11 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  49.38 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  47.16 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  47.16 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  46.89 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.17 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.51 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.66 
 
 		 344 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.08 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  49.17 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  48.58 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.7 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  48.85 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.46 
 
 		 356 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47.3 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.49 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  44.79 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.88 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.19 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  46.73 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  46.36 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  46.9 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  48.48 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  48.47 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.33 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.79 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.55 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.48 
 
 		 320 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.35 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.65 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.02 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  47.33 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.04 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  42.11 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  47.19 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  45.21 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  45.32 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.99 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.18 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.24 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.64 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.87 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  46.03 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  45.87 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.71 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.57 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  47.67 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.57 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  46.32 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.53 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.56 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.92 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.34 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.41 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.79 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>