More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2507 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  74.41 
 
 
325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  70.9 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.99 
 
 
330 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  51.19 
 
 
349 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.19 
 
 
328 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.51 
 
 
330 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.36 
 
 
324 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.12 
 
 
325 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0789  hypothetical protein  88.12 
 
 
160 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565793  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.48 
 
 
333 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.16 
 
 
327 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  46.85 
 
 
329 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.23 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.2 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.24 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.23 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.98 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.14 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.97 
 
 
328 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  45.48 
 
 
337 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.84 
 
 
360 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  46.32 
 
 
328 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.19 
 
 
325 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.33 
 
 
328 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.9 
 
 
334 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.48 
 
 
345 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.48 
 
 
345 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.73 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.07 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.73 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.34 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.48 
 
 
330 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.77 
 
 
336 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.9 
 
 
332 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.33 
 
 
321 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  47.65 
 
 
330 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  48.52 
 
 
358 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  44.95 
 
 
330 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  44.06 
 
 
329 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  49.65 
 
 
326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.52 
 
 
328 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.46 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.19 
 
 
328 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  41.69 
 
 
335 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.82 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.04 
 
 
335 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.12 
 
 
336 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  45.64 
 
 
327 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.34 
 
 
335 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.98 
 
 
335 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.09 
 
 
335 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.63 
 
 
335 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.75 
 
 
325 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  43.85 
 
 
322 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.38 
 
 
351 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.82 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.28 
 
 
333 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  47.56 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  46.05 
 
 
325 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.37 
 
 
356 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  44.91 
 
 
341 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.28 
 
 
330 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 
330 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43 
 
 
337 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.22 
 
 
330 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  42.9 
 
 
326 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  45.07 
 
 
359 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.97 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  41.36 
 
 
321 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.97 
 
 
325 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 
326 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.2 
 
 
324 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  45.54 
 
 
321 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.15 
 
 
322 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  48.25 
 
 
328 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.29 
 
 
335 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.09 
 
 
304 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.96 
 
 
328 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.97 
 
 
323 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  45.3 
 
 
327 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.3 
 
 
325 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44.48 
 
 
334 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.92 
 
 
314 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  43.85 
 
 
324 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.83 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.67 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.21 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.68 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.55 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.31 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  43.41 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.48 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.74 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>