More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1868 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  75.3 
 
 		 327 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  69.09 
 
 		 330 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  69.09 
 
 		 330 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  71.53 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  64.77 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  64.43 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.71 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  49.16 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  49.16 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  49.4 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.66 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.02 
 
 		 360 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.09 
 
 		 333 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.84 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  47.35 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  48.19 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  51 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  48.33 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  50.5 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.15 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.6 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.97 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.88 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  49.83 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.04 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.68 
 
 		 330 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  47.34 
 
 		 335 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.18 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  49.5 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.63 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.1 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.21 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.21 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.41 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  47.4 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.6 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.84 
 
 		 325 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.68 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.99 
 
 		 322 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.38 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  47.85 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  48.15 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  46.64 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  48.74 
 
 		 338 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  47.33 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.95 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.48 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.65 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.52 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.05 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.67 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.64 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.37 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  43.73 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.33 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  46.98 
 
 		 698 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.42 
 
 		 335 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44.65 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.82 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  45.09 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  47.12 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.83 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.97 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.33 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  47.16 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  45.33 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.71 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  46.82 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  49.17 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.55 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.3 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  47 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  43.67 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  45.13 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  46.36 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  48.23 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.63 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.64 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  45.4 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  46.62 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.79 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.7 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.55 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  41.39 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.33 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  45.7 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.6 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>