More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4611 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  59.46 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  51.79 
 
 		 333 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  52.27 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  50.47 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  47.18 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  51.97 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.5 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.33 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.33 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.96 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  47.24 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  45.89 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.38 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  44.34 
 
 		 329 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  51.97 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  48.22 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.64 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.14 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.01 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  47.51 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  45.39 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.1 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  52.16 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.54 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.25 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.16 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.56 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.9 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.96 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.24 
 
 		 324 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.77 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  44.75 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.17 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  43.22 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  46.59 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  47.51 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.19 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.53 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.72 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.04 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  45.3 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.59 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.29 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  44.74 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.56 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.18 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  45.1 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.61 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.22 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.29 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.69 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.83 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.18 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.78 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.51 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.73 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.85 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.68 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  41.18 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.97 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.72 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.95 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.22 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.72 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.95 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.95 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.56 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.89 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.28 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  44.66 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  44.75 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  45.82 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.31 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45.78 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.78 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.9 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.65 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.65 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  44.82 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.19 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.3 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.63 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44.08 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.62 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>