More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3789 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 326 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  48.58 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.03 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.62 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.34 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.56 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.27 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.24 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.22 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.57 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.78 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.65 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.37 
 
 		 349 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  46.38 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.98 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.98 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.51 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.84 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.29 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.53 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.61 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.75 
 
 		 356 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.04 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.56 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.23 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.38 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  42.45 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.38 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  40.74 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.92 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.11 
 
 		 335 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.03 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.67 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.52 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.03 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.49 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.86 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  43.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.11 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  42.43 
 
 		 326 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.84 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  44.11 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.32 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  43.17 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.06 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.11 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.72 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.58 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.81 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  39.87 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.81 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  43.92 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.37 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.45 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.43 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.76 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.77 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.65 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.88 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  41.2 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.91 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.38 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.81 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.4 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.72 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.69 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.82 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.72 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.95 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.33 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.57 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.22 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.06 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.26 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  39.74 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.06 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.8 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.88 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.69 
 
 		 320 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.43 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.3 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.46 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.19 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  43.67 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  42.42 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.14 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>