More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1913 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  71.29 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  65.81 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  50.61 
 
 
347 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  47.53 
 
 
327 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.9 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  47.71 
 
 
320 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  46.67 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44.48 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  48.51 
 
 
328 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  48.18 
 
 
353 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  41.85 
 
 
325 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  43.58 
 
 
325 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.53 
 
 
326 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.16 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.25 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  43 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  44.1 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  42.76 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  41.38 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  44.27 
 
 
321 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  44.27 
 
 
321 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.22 
 
 
344 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.9 
 
 
339 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.5 
 
 
328 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  42.19 
 
 
327 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 
326 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.63 
 
 
348 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.07 
 
 
328 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  41.49 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.78 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 
331 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.03 
 
 
330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.22 
 
 
318 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  40.73 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.67 
 
 
356 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  43.92 
 
 
322 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.74 
 
 
325 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  47.16 
 
 
330 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.38 
 
 
331 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.06 
 
 
328 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.42 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.22 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.5 
 
 
334 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.39 
 
 
330 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  40.49 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  39.47 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  40.25 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 
328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  40.53 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.07 
 
 
330 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  41.56 
 
 
331 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.47 
 
 
330 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.47 
 
 
330 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.94 
 
 
324 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.73 
 
 
356 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 
335 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.46 
 
 
330 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.78 
 
 
331 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.22 
 
 
698 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.27 
 
 
328 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.75 
 
 
356 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.29 
 
 
328 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.29 
 
 
328 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  41.36 
 
 
322 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.52 
 
 
326 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.59 
 
 
332 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.85 
 
 
335 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  41.23 
 
 
323 aa  228  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  38.53 
 
 
330 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  41.14 
 
 
326 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.25 
 
 
323 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  40.2 
 
 
324 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.62 
 
 
325 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.85 
 
 
332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.84 
 
 
344 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.98 
 
 
333 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  42.09 
 
 
332 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  40.39 
 
 
329 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  43.23 
 
 
334 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.73 
 
 
332 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  40.96 
 
 
326 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41 
 
 
338 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.61 
 
 
322 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.13 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  38.76 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.79 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  39.64 
 
 
333 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.55 
 
 
327 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.85 
 
 
332 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.13 
 
 
341 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 
329 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>