More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4494 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  77.85 
 
 
330 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  76.87 
 
 
349 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  61.13 
 
 
320 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  58.18 
 
 
331 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  60.27 
 
 
325 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  61.62 
 
 
326 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  56.84 
 
 
328 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  60.27 
 
 
325 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  55.31 
 
 
328 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  58.14 
 
 
335 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  54.36 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  48.67 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  46 
 
 
322 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.67 
 
 
327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.65 
 
 
344 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  50.38 
 
 
334 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.22 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.22 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  45.02 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.03 
 
 
349 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.37 
 
 
352 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.45 
 
 
327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 
331 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.58 
 
 
330 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  46.33 
 
 
327 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.68 
 
 
328 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.72 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.72 
 
 
328 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.79 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.19 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.75 
 
 
336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  41.86 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.24 
 
 
326 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.51 
 
 
318 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.51 
 
 
329 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.24 
 
 
323 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.4 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.59 
 
 
334 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.11 
 
 
325 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 
330 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  46.64 
 
 
359 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.97 
 
 
339 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  41.9 
 
 
321 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  41.9 
 
 
321 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.77 
 
 
336 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 
328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.71 
 
 
362 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.05 
 
 
335 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.75 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.55 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  41.89 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.38 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.75 
 
 
325 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.94 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.28 
 
 
332 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.81 
 
 
339 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.21 
 
 
346 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.47 
 
 
323 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  42.01 
 
 
327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.94 
 
 
333 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.69 
 
 
341 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.72 
 
 
322 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  45.36 
 
 
321 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.65 
 
 
331 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.65 
 
 
331 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.7 
 
 
324 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.18 
 
 
358 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  42.3 
 
 
332 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.06 
 
 
322 aa  235  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.35 
 
 
332 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.12 
 
 
327 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.25 
 
 
320 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.74 
 
 
333 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  41 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.69 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.25 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.47 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.32 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.27 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.94 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  40.82 
 
 
321 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.08 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.07 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.32 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
328 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.61 
 
 
317 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  39.02 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.61 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>