More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2429 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  81.35 
 
 
325 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  81.04 
 
 
325 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  69.23 
 
 
328 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  64.71 
 
 
320 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  63.21 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  64.67 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  63.33 
 
 
349 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  61.62 
 
 
330 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  55.25 
 
 
335 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  49.09 
 
 
328 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  50.84 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  47.33 
 
 
327 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.94 
 
 
358 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.93 
 
 
326 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  44.38 
 
 
327 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.18 
 
 
328 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.23 
 
 
339 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 
328 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  43.12 
 
 
340 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 
331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.38 
 
 
327 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.38 
 
 
323 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.28 
 
 
698 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.76 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.52 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.76 
 
 
331 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.82 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.41 
 
 
333 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  43.17 
 
 
341 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.49 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.43 
 
 
335 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.12 
 
 
322 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.18 
 
 
341 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.36 
 
 
336 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.26 
 
 
334 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.69 
 
 
330 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.86 
 
 
324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.48 
 
 
336 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.61 
 
 
327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.33 
 
 
327 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.33 
 
 
325 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.61 
 
 
339 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.21 
 
 
335 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.82 
 
 
344 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.33 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.05 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  41.43 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.94 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.08 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.28 
 
 
330 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.35 
 
 
332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  40.18 
 
 
333 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.83 
 
 
325 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.89 
 
 
335 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.87 
 
 
386 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 
339 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.06 
 
 
321 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.27 
 
 
339 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.67 
 
 
346 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  40.18 
 
 
333 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.76 
 
 
318 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  39.76 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.61 
 
 
356 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 
332 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  39.53 
 
 
326 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.12 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.47 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
347 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.84 
 
 
332 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.23 
 
 
345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.97 
 
 
327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  39.33 
 
 
322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.23 
 
 
345 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  43.16 
 
 
324 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.67 
 
 
324 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  38.51 
 
 
341 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.47 
 
 
328 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.58 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.61 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  39.51 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.83 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.7 
 
 
325 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.94 
 
 
353 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.2 
 
 
324 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  39.06 
 
 
327 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.16 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.92 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  39.88 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.6 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  40.37 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.28 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>