More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1372 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  48.26 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  47.3 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  45.45 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  44.74 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  39.05 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.72 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.81 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  38.59 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 322 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  41.25 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.61 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.85 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.31 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.51 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.14 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.12 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  41.91 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.01 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.45 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.33 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.93 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  41.86 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.7 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.06 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.46 
 
 		 338 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.17 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.98 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 358 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.29 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.61 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.33 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.38 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.72 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 326 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.72 
 
 		 698 aa  238  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.85 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  42.47 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.17 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.46 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.07 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.44 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.33 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  41.23 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  37.07 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.06 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.2 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.02 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.14 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  40.98 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.86 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.36 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.61 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  41.16 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.13 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  39.14 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.27 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.33 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.16 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.27 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.98 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.39 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  41.06 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.72 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.6 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.81 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  41.08 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.67 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.04 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  40.62 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  41.12 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  41.41 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  39.53 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  40.75 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.36 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>