More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0879 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  72.98 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  72.98 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  67.18 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  64.81 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  56.04 
 
 		 322 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  49.33 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  46.63 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  46.64 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.64 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45.45 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.1 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.6 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  46.82 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  46.82 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.62 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  48.66 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  44.97 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.94 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.19 
 
 		 339 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.81 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.99 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.41 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.41 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.81 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  43.12 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.29 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  43.25 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.74 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  41.27 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  42.37 
 
 		 318 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.09 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.38 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.71 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40.27 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.24 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.62 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.26 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.48 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.6 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  39.01 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  41.9 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  42.16 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.15 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  37.89 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  43.1 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  41.19 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  38.74 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.61 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.94 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  41.08 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  38.59 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  38.59 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  39.76 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 347 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.23 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.42 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  38.61 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.94 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  39.76 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.23 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.39 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.95 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  42.62 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.46 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  41.69 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  38.65 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  43.77 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  39.41 
 
 		 329 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.89 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.94 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.12 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.34 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.5 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.34 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  38.93 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.12 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  39.88 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  39.14 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>