More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5118 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  76.88 
 
 		 320 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  74.06 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  75.96 
 
 		 318 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  75.94 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  75.94 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  72.84 
 
 		 324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  71.83 
 
 		 327 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  70.31 
 
 		 324 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  70.77 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  66.88 
 
 		 328 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  70.81 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  70.81 
 
 		 322 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  67.33 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  62.71 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  58.05 
 
 		 326 aa  354  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  55.78 
 
 		 322 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  56.27 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  55.45 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  55.45 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  51.68 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  51.59 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.37 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  45.83 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  47.15 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.42 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  43.61 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  44.72 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.04 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.48 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.88 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.62 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.56 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.29 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.41 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.3 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.11 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.72 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.37 
 
 		 344 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.69 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.9 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.54 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.26 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.33 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.83 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.33 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.33 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.56 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.12 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.23 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.35 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.23 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  41.24 
 
 		 337 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.02 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.07 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.89 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.68 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.8 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.39 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.49 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.75 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.39 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.61 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  39.01 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.98 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.79 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.11 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.85 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  41.1 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.81 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 358 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.19 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 329 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.8 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.36 
 
 		 344 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  40.31 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.28 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.4 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.33 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.13 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>