More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3894 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3515  hypothetical protein  54.83 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327733  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.32 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  48.73 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  46.31 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.33 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.33 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.33 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.31 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.2 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.2 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.97 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  47.81 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.97 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.97 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.82 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.42 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.3 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.97 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.51 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  43.75 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.24 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.85 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.78 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.55 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.8 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.95 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  42.95 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.12 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.63 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.41 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  48.48 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.46 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.51 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  46.26 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.55 
 
 		 333 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.5 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  46.64 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.62 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.37 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.12 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.72 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.38 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.81 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.21 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.82 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44.48 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  48.49 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.89 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  46.15 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  42.07 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.92 
 
 		 324 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.15 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  43.29 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.55 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44.3 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.57 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.83 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  43.52 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.55 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  45.48 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.87 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.48 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  46.15 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  44.82 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  42.59 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.99 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.38 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.64 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  43.33 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.85 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.25 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.28 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  43.29 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46.18 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.61 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.61 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  44.78 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.49 
 
 		 332 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41.55 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.51 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.47 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  39.44 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.43 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>