More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0436 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  670    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  65.45 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  63.58 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  60.06 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  59.88 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  62.58 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  56.89 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  49.55 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  49.56 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.59 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.42 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.86 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  38.74 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.98 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.84 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.64 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.19 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.36 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  37.8 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.3 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.33 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.58 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.58 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.48 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.44 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.44 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.29 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  40.74 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.48 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.86 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.34 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.46 
 
 		 346 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.24 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.6 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.34 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.4 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.83 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.91 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.5 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  39.04 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.98 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.02 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.48 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.9 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  38.59 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.61 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.47 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.13 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  40.39 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.17 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.7 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.68 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.38 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.23 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.87 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.72 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.65 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.95 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.14 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.1 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  37.34 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  39.26 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  38.25 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.8 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  36.34 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.98 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  38.07 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.66 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.13 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>