More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3459 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  80.95 
 
 		 318 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  77.78 
 
 		 320 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  83 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  83 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  72.84 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  74.69 
 
 		 320 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  72.14 
 
 		 327 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  66.67 
 
 		 324 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  70.43 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  68.67 
 
 		 332 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  68.55 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  68.9 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  68.9 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  60.4 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  57.72 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  56.15 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  55.14 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  55.8 
 
 		 356 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  55.81 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  48.99 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.86 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  46.46 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  46.46 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.56 
 
 		 328 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  45.23 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.74 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  47.23 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  47.51 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.67 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  47.18 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  47.93 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  45.09 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.98 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  42.94 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.56 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.28 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  43.56 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.32 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.07 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.84 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.31 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  41.98 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.09 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.95 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.95 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  41.05 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.53 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.36 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.18 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.77 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.1 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  42.76 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.75 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.05 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.77 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.55 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.6 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.89 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.24 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.74 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.81 
 
 		 334 aa  245  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 331 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.81 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.44 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  40.69 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.35 
 
 		 366 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.92 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  42.71 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 347 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.16 
 
 		 312 aa  242  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.04 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.05 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.44 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.33 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40.6 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.19 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.67 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  42.59 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  41.53 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>