More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2648 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  89.8 
 
 		 314 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.42 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.47 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.08 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.19 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  47.13 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.12 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.15 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.67 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.07 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  44.59 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.01 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.42 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.67 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.9 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.27 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.99 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.32 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.02 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.99 
 
 		 355 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.76 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.18 
 
 		 356 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.1 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.1 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.34 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.19 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.56 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  43 
 
 		 334 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.89 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.14 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.25 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.55 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.48 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  42.62 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.18 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.61 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.69 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  42.18 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.93 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.53 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.44 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  43.62 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.62 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.26 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.26 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  43.39 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.3 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.04 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.36 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.28 
 
 		 317 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  42.26 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.92 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.82 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.38 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  42.02 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.98 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  41.78 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40.67 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.4 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  41.72 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.28 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  40.34 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.17 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.78 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.59 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  42.11 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.54 
 
 		 344 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.14 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  40.66 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  40.66 
 
 		 344 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.27 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.14 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  43.25 
 
 		 324 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.57 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.97 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  41.8 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.22 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  37.95 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.26 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.39 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.33 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>