More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3994 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  62.11 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  62.11 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  61.18 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  58.39 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  56.04 
 
 		 322 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  45.48 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  50.17 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  45.39 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  48.36 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.86 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  47.54 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  45.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.87 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  46.95 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.61 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.95 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46.76 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.39 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  45.58 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  45.08 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.52 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  41.41 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.37 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.62 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  43.38 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.88 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.32 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.64 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.39 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  41.54 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  42.32 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.55 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  41.55 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.87 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.87 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.25 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.25 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.33 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.98 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.66 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.58 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.66 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.56 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  41.33 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.83 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.55 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.96 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  40.88 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.23 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  42.32 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.53 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.22 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.37 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  43.79 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.05 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  39.17 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.56 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.38 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  45.08 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.16 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  41.27 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.92 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.32 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.31 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.17 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  40.96 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.52 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.32 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.89 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  40.96 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.27 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.01 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.38 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.15 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.43 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.84 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.96 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  42.15 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.53 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.25 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.3 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.65 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.55 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.61 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>