More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5741 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  75.33 
 
 		 344 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.41 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  46.34 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.2 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  50.16 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.16 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  47.49 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  49.52 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.4 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.88 
 
 		 346 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.51 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  46.23 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  44.98 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  45.54 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  46.23 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.08 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.62 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.25 
 
 		 360 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  46.58 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.45 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.45 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  51.66 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.58 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.36 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.98 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  46.51 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.48 
 
 		 349 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.38 
 
 		 327 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  46.41 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  48.47 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  45.03 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50.16 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.52 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.95 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.68 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.14 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.85 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.01 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.2 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.89 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.2 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.51 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.07 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  46.05 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.07 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  47.39 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  44.12 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.07 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  45.18 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.13 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.02 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.15 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.86 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  44.63 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.75 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.39 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.1 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.03 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.03 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.46 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.98 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  45.9 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.75 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.51 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.84 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  47.18 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.68 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  46.58 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  45.51 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  45.42 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.87 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.93 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  44.63 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.38 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.18 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.6 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.05 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.9 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.19 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.04 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.6 
 
 		 330 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  45.76 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.72 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.99 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.42 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.88 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.18 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  48.68 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.44 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>