More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0596 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  76.72 
 
 		 339 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  75.56 
 
 		 345 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  75.56 
 
 		 345 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  76.47 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  70.24 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  68.08 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  67 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  57.19 
 
 		 335 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  56.44 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  55.45 
 
 		 335 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  52.45 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  55.66 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  54.98 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  50.9 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  54.37 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  54.46 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  54.98 
 
 		 328 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  51.2 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  51.2 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  52.09 
 
 		 330 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.3 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  49.4 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.85 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  53.8 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.54 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  49.85 
 
 		 333 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  52.33 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  51.59 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  47.11 
 
 		 330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  52.09 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  51.97 
 
 		 328 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  45.73 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  45.73 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  52.13 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  47.02 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  50.67 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  49.7 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  47.18 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.51 
 
 		 327 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.33 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  53.4 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.49 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.75 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  48.51 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50.33 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.88 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  49.19 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  51.05 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  48.52 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  51.15 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  51.15 
 
 		 325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.16 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.81 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  48 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  52.63 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  49.17 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  48.64 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  48.94 
 
 		 323 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  47.72 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  49.05 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.78 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  50.96 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  44.58 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  46.5 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  49.67 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  49.5 
 
 		 331 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.38 
 
 		 344 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  46.53 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.33 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.1 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  49.83 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.17 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  48.23 
 
 		 323 aa  292  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.57 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.58 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.65 
 
 		 325 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  50.5 
 
 		 323 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  47.96 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  47.49 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.69 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  45.27 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  51.63 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  46.06 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  46.93 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.62 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  47.67 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  46.5 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.78 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  46.48 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  46.2 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.37 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.98 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.19 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.51 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  46.81 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  46.81 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>