More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2833 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  74.09 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.75 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.42 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  46.51 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  47.02 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.22 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  43.73 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  44.33 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  47.28 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.1 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.9 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.94 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40.82 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  42.32 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.71 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  40.95 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  42.14 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.5 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.5 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  42.14 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  41.3 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  41.1 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.57 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.21 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.91 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.47 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40.31 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40.31 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  43.31 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  39.14 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.32 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.61 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 		 328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.17 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.76 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  44.12 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.19 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.52 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  39.51 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.61 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  39.14 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.76 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.07 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.32 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  38.2 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  38.2 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  39.33 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.76 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.79 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  38.08 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  37.5 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.34 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.99 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  41.5 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.86 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  39 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  36.45 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.35 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.52 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.2 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  35.88 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.92 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.87 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.66 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  36.72 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.19 
 
 		 339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.35 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 317 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  38.14 
 
 		 320 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.99 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  39.31 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.38 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.61 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.87 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.87 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  36.27 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.77 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.48 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.42 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  39.09 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  39.04 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.64 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.39 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>