More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2912 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  673    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  71.04 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  49.48 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  47.09 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.47 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  47.32 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.34 
 
 		 328 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  48.03 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.22 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.71 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.36 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.33 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  41.85 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.21 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  43.22 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  40.12 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.59 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40.48 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  43.35 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.57 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.16 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  36.69 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.16 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.16 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.81 
 
 		 360 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.14 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  43.6 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  40.46 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.5 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.09 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  39.14 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.09 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  40.47 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  42.21 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  40.47 
 
 		 322 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.5 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.5 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.18 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.77 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  39.73 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.24 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.46 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.07 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  38.97 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  42.24 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  43.79 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  38.97 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.93 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.99 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.93 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.19 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  40.12 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.06 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.79 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.86 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.88 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.75 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.08 
 
 		 324 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.41 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.92 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.96 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.18 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.76 
 
 		 329 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.99 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 326 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.1 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.65 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.08 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  39.63 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.84 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  39.5 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.38 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.36 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  38.89 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  38.94 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.67 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  34.93 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  38.24 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.21 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.52 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.22 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.01 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.31 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.08 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  38.27 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.16 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>