More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0989 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  99.69 
 
 		 325 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  70.48 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  65.98 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  69.15 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  62.15 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  61.54 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  60.8 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  59.8 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  58.78 
 
 		 322 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  66.56 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  49.82 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.85 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  39.93 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.88 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.34 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.26 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.25 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  38.34 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.13 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.19 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.7 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.94 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  34.45 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.08 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  35.57 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.74 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  39.07 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  40.8 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  36.65 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.49 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.33 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.67 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.55 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  41.43 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.97 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.98 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.81 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  38.87 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  40.39 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.42 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.26 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  36.18 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  36.18 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.16 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  39.79 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.34 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.51 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.51 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  35.67 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  34.67 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.6 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  34.67 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.18 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  36.51 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  33.75 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.67 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.17 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.14 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  39.13 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.17 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  37.75 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.12 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  37.75 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.26 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.03 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.71 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.55 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  36.45 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  38.23 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  37.73 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.12 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  38.28 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.21 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  38.18 
 
 		 334 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.13 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.65 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>