More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0026 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  87.67 
 
 		 322 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  64.8 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  65.11 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  65.68 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  60 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  61.02 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  59.47 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  59.67 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  59.33 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  57.74 
 
 		 320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  42.05 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.08 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  40.4 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.72 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  40.56 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.17 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.39 
 
 		 328 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.71 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.81 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.38 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.16 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.81 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.5 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.21 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.51 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.24 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.31 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.48 
 
 		 333 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.33 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.66 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.67 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.51 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.12 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  39.01 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.8 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.38 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.08 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.8 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.8 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.51 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  41.19 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.63 
 
 		 353 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.09 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.53 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.46 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  37.73 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.03 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.36 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.77 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.74 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.53 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.62 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.07 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.67 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  35.79 
 
 		 320 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.03 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.69 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.2 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.46 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  37.05 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  39.4 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  37.96 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.95 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.71 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.64 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.96 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.45 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.35 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  34.7 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.41 
 
 		 332 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.83 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.86 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.74 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>