More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1892 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  49.82 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  46.84 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  49.47 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  47.84 
 
 		 318 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  47.18 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  44.79 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  46.1 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  44.13 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  41.69 
 
 		 363 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  50.88 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  41.97 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  36.01 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  36.71 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.38 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  34.53 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.13 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  34.3 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.63 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  34.95 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  30.74 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  32.75 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  36.08 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  36.08 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  30.88 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  30.88 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  34.92 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.87 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  32.05 
 
 		 324 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.87 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.04 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  33.57 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  34.52 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  34.94 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  30.32 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  38.08 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  35.34 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.93 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  33.75 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.93 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  35.69 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  32.48 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  31.47 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  31.36 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  33.68 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  33.57 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  32.5 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  36.77 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  32.5 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.88 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  32.99 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  32.75 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  33.9 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  34.97 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  33.56 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  31.56 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  31.23 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  37.76 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  34.26 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  31.69 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  32.88 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  34.97 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  31.36 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  32.89 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  30.61 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  28.67 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  32.45 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  32.07 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  30.93 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  35.52 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  36.52 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  34.45 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.76 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  31.38 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.15 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  34.45 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.27 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  33.8 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.44 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  33.92 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  33.89 
 
 		 344 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  29.97 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  32.29 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  33.45 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.8 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.35 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  34.57 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  30.58 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>