More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0058 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  86.97 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  64.47 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  63.01 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  62.7 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  60.98 
 
 		 332 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  60.73 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  62.71 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  58.39 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  58.05 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  56.55 
 
 		 320 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  42.66 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.05 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.39 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.01 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.73 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.47 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  40.94 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  40.75 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.03 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  40.67 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  44.7 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.55 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.37 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.86 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.27 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.67 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  42.14 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.45 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.79 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.49 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.33 
 
 		 356 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.73 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  39.25 
 
 		 323 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.59 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.46 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.46 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.94 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.79 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.16 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.92 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.47 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.99 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.45 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.54 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.71 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.52 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.8 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.69 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  40.06 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  38.74 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  41.38 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  37.68 
 
 		 320 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.94 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.96 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.59 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.51 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  39 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.72 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39.33 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.6 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  39.4 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.26 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.2 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  37.77 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.64 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.2 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.13 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.51 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  36.25 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.08 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  36.19 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.52 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  37.93 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  38.8 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>