More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1314 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  72.09 
 
 
332 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  70.57 
 
 
325 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  70.23 
 
 
325 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  71.19 
 
 
318 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  60.67 
 
 
322 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  59.47 
 
 
363 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  56.79 
 
 
317 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  56.76 
 
 
332 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  55.86 
 
 
332 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  63.3 
 
 
320 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  47.18 
 
 
309 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.53 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.06 
 
 
328 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  43.04 
 
 
328 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.35 
 
 
330 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  40.84 
 
 
330 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.52 
 
 
336 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.6 
 
 
332 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.01 
 
 
328 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.82 
 
 
336 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  40.2 
 
 
328 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 
326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.28 
 
 
332 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.07 
 
 
327 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.37 
 
 
322 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.87 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.8 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  40.74 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  41.06 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.64 
 
 
332 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.62 
 
 
320 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.35 
 
 
324 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  37.05 
 
 
321 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  37.05 
 
 
321 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.36 
 
 
330 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.36 
 
 
330 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.73 
 
 
325 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.24 
 
 
331 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.31 
 
 
349 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.85 
 
 
324 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.87 
 
 
327 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 
326 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  34.44 
 
 
326 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.33 
 
 
333 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  37.21 
 
 
330 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41 
 
 
328 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  39 
 
 
336 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.07 
 
 
334 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.22 
 
 
330 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.07 
 
 
325 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  38.99 
 
 
326 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.79 
 
 
304 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.13 
 
 
339 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.07 
 
 
322 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 
348 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  33.67 
 
 
320 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  34.68 
 
 
322 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.39 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.38 
 
 
325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  38.25 
 
 
322 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  39.93 
 
 
322 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.72 
 
 
322 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  34.34 
 
 
322 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  34.34 
 
 
322 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.73 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.46 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  37.37 
 
 
323 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  37.16 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.13 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.04 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  37.63 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.71 
 
 
332 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.88 
 
 
325 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.67 
 
 
332 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.28 
 
 
328 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  32.42 
 
 
332 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.22 
 
 
337 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.97 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  34.17 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.66 
 
 
330 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  35.12 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.54 
 
 
356 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  38.96 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.83 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.28 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  40.78 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.68 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  38 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.1 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  38.29 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.88 
 
 
325 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.54 
 
 
321 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.31 
 
 
335 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.74 
 
 
345 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  37.04 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  37.04 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>