More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5116 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  69.58 
 
 		 325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  69.28 
 
 		 325 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  72.09 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  65.87 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  59.8 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  61.15 
 
 		 322 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  57.49 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  57.8 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  60 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  64.19 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  46.84 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.5 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.47 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.26 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.57 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.06 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.26 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.57 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  40.55 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  38.75 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.13 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  35.57 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.8 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.62 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.62 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.76 
 
 		 356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.42 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  40.85 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.06 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.97 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.14 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.46 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  38.67 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  35.91 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.68 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.2 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.74 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.13 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.06 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.6 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.64 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.02 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.3 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.53 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  38.67 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.29 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  39.14 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.25 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  40.31 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  33.54 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.08 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.98 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.03 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.51 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  38.1 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.86 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  34.65 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  39.27 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.8 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  34.65 
 
 		 322 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.87 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  37.79 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  37.39 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  36.92 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.09 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.83 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.58 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.58 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  38.24 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  40.24 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  37.24 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  33.54 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  36.25 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  36.87 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.68 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  38.75 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.86 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>