More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3457 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  71.19 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  69.15 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  68.81 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  63.84 
 
 		 332 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  60.06 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  61.34 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  62.71 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  59.44 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  61.02 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1718  hypothetical protein  60.51 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1892  hypothetical protein  47.08 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.11 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.64 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.39 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.75 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.91 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.57 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.37 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.13 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.62 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.59 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.25 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.39 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.39 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.27 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.57 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  40.66 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.91 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  34.27 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  34.63 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41.64 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  38.94 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  39.42 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  36.5 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  39.12 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.53 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.88 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.67 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.69 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  39.19 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  41.2 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  36.15 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.46 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.06 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  35.53 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  34.95 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  34.95 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  38.15 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  34.5 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.16 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  36.27 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.39 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.73 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  38.82 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.88 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.66 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.84 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.39 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  37.63 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.74 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.01 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.07 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  33.76 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.39 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.18 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.67 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  38.89 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.85 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  39.3 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  37.27 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.14 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.98 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.59 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.85 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.51 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.75 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.98 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.13 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.23 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.8 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.48 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  35.35 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  35.38 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>