More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1383 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  60.13 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  55 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  52.28 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  49.35 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  49.51 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  49.33 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  53.51 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  49.53 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  46.53 
 
 		 349 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  44.88 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  46.98 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  44.88 
 
 		 334 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.18 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.71 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.23 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  46.67 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  46.67 
 
 		 330 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.98 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.31 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  46.08 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.53 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.65 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.53 
 
 		 333 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.41 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.26 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.95 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.19 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.45 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  41.54 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  45.43 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.77 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.93 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.93 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  41.8 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  44.41 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.54 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.85 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.15 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.81 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.85 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.85 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.16 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.83 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.92 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.49 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.81 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.4 
 
 		 327 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.89 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  45.14 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.19 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.52 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  41.64 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.49 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.26 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  42.81 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.8 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  42.09 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.07 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.8 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.12 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  39.87 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.56 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.73 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  45.14 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.23 
 
 		 353 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  45.85 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  42.95 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.19 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.33 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.43 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.03 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.15 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.33 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.74 
 
 		 353 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.18 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 		 358 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.27 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.57 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  44.18 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.28 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  41.52 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.06 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  40.94 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.69 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  44.37 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  41.08 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>