More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0576 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  53.14 
 
 
342 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  50.99 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  50.17 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  48.15 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  50.33 
 
 
349 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  50.33 
 
 
331 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  48.7 
 
 
337 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  50.97 
 
 
333 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  49.01 
 
 
314 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  46.64 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  45.97 
 
 
339 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  45.08 
 
 
333 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  44.88 
 
 
332 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  41.3 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.49 
 
 
339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  41.53 
 
 
325 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.18 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.09 
 
 
330 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.08 
 
 
336 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.28 
 
 
326 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.19 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.44 
 
 
339 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.57 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  43.83 
 
 
326 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.9 
 
 
333 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.39 
 
 
328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.31 
 
 
325 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  44.52 
 
 
332 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.85 
 
 
325 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.47 
 
 
349 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.63 
 
 
358 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.91 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.91 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  42 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  43.61 
 
 
325 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 
328 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.3 
 
 
328 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.55 
 
 
328 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.71 
 
 
356 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.81 
 
 
355 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.87 
 
 
330 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.87 
 
 
330 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.23 
 
 
332 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.67 
 
 
322 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.33 
 
 
324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.45 
 
 
310 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.07 
 
 
323 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 
326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  41.78 
 
 
371 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.77 
 
 
339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.77 
 
 
333 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.59 
 
 
360 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.65 
 
 
332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.37 
 
 
325 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.22 
 
 
327 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 
328 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.04 
 
 
327 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  44.33 
 
 
343 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.38 
 
 
327 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.95 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.1 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.67 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  43.67 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.12 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.53 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.48 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.19 
 
 
328 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  42.3 
 
 
332 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  44.97 
 
 
327 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44 
 
 
323 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.42 
 
 
324 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.52 
 
 
333 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  45.19 
 
 
330 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.39 
 
 
326 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  42.72 
 
 
343 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.09 
 
 
325 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  41.86 
 
 
324 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.52 
 
 
334 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  39.16 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.33 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.67 
 
 
338 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.8 
 
 
336 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.76 
 
 
338 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  41.21 
 
 
331 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.12 
 
 
330 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.23 
 
 
330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  41.59 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  41.75 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.98 
 
 
327 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 
322 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>