More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3862 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  49.51 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.56 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  46.49 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.77 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  45.78 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.73 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.64 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.15 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.13 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.28 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.05 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.53 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.78 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.41 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.41 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.09 
 
 		 326 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.44 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46.31 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  44.34 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.98 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.97 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  45.3 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.4 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.81 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.97 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.88 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.74 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  44.52 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.48 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.52 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.3 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  44.41 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  44.08 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.91 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  45.07 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  43.31 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.63 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  44.19 
 
 		 698 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.37 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  43.41 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.81 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.12 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  42.4 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  40.69 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.91 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.27 
 
 		 325 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.33 
 
 		 335 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.5 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  42 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.05 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  41.3 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.59 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4676  hypothetical protein  42.03 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.04 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.14 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.75 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.35 
 
 		 343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  42.63 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.27 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  42.27 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  39.63 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  42.63 
 
 		 330 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.75 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.19 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.48 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.19 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.8 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.82 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  43.42 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  44.08 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>