More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0619 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  48.15 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.75 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  46.08 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.7 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.71 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.33 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.48 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.64 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.73 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.66 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.53 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.47 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.81 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.73 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.66 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.15 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.71 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.57 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.18 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.81 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.22 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.88 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  43.08 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.29 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  42.39 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.37 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.26 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.33 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.28 
 
 		 353 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  42.67 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  41.61 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.14 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.14 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.15 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  44.41 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  40.25 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.22 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.33 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.2 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  41.89 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  40.79 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.86 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.93 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.96 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  45.72 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.31 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.94 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.88 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  45 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.28 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.51 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.72 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.04 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  38.73 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  44.26 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.04 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.88 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.2 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  42.44 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  42.28 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.76 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  42.33 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.43 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.95 
 
 		 335 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41 
 
 		 335 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.89 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.95 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.08 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.87 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.38 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  40.67 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.04 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.72 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.67 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>