More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5574 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 330 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  51.52 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  53.47 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  52.43 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  53.23 
 
 		 345 aa  331  9e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  53.57 
 
 		 360 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  53.23 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  51.23 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.77 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  51.46 
 
 		 339 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.83 
 
 		 339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.68 
 
 		 330 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.51 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  46.58 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.02 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.71 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.88 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  47.58 
 
 		 326 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.7 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.77 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.49 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.85 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.58 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.71 
 
 		 314 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.42 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48.84 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.42 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.56 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.47 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.18 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  47.13 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.2 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  44.63 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.76 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.39 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.39 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.65 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  45.36 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.63 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.18 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.03 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.72 
 
 		 324 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.72 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.31 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  44.41 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.02 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  45.54 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.84 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.26 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.33 
 
 		 349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.9 
 
 		 346 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.55 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.44 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  45.14 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.94 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.21 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  46.2 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.17 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.2 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.78 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.42 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.54 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.92 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.92 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.16 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.07 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  45.16 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.17 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.22 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  42.41 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.83 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.24 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.16 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.55 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  45.78 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.34 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.08 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.58 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.33 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  42.27 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.69 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  44.48 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.51 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.7 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  41.21 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.19 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.88 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  44.75 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.47 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>