More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1733 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  99.39 
 
 
330 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  75.23 
 
 
333 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  73.33 
 
 
371 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  70 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  79.87 
 
 
331 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  54.03 
 
 
349 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  53.49 
 
 
326 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  50.61 
 
 
333 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  50.16 
 
 
337 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  50.67 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  46.67 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  52.94 
 
 
314 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  49.85 
 
 
331 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  49.33 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  50.82 
 
 
339 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.82 
 
 
327 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.18 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.64 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.78 
 
 
330 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  47.35 
 
 
342 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.88 
 
 
333 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  47 
 
 
325 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.53 
 
 
333 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.9 
 
 
339 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.5 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  44.52 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.28 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.28 
 
 
345 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.63 
 
 
339 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  44.33 
 
 
328 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 
335 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  44.27 
 
 
324 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.45 
 
 
360 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.64 
 
 
330 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.63 
 
 
328 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 
326 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 
328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.6 
 
 
339 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.97 
 
 
339 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  44.07 
 
 
323 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.7 
 
 
324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.14 
 
 
334 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.81 
 
 
326 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.19 
 
 
344 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.56 
 
 
325 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.47 
 
 
336 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.72 
 
 
344 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.61 
 
 
322 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.12 
 
 
328 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.04 
 
 
314 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.28 
 
 
338 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.28 
 
 
331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.9 
 
 
353 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.19 
 
 
328 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.19 
 
 
328 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.72 
 
 
328 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.15 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.15 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.16 
 
 
327 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.68 
 
 
334 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.37 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.52 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.75 
 
 
325 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.33 
 
 
324 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.64 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.75 
 
 
304 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 
332 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.49 
 
 
346 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.22 
 
 
332 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.28 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.81 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 
358 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 
330 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
322 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.96 
 
 
355 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.21 
 
 
331 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.73 
 
 
339 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.21 
 
 
331 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.96 
 
 
330 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.9 
 
 
334 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  43.85 
 
 
322 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.44 
 
 
335 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.61 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.69 
 
 
325 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.19 
 
 
335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.1 
 
 
322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.36 
 
 
328 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.3 
 
 
335 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.17 
 
 
334 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.91 
 
 
325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 
349 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.59 
 
 
324 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.06 
 
 
331 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>