More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1691 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  88.93 
 
 
328 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  68.33 
 
 
327 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  65.67 
 
 
330 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  65.67 
 
 
330 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  68.37 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  62.2 
 
 
330 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  52.84 
 
 
330 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  52.84 
 
 
330 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  54.28 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  52.79 
 
 
360 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  53.18 
 
 
339 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  51.13 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  49.04 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.24 
 
 
336 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.7 
 
 
328 aa  298  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  49.68 
 
 
327 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.4 
 
 
325 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.17 
 
 
333 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  49.51 
 
 
345 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  46.08 
 
 
335 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  49.51 
 
 
345 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.8 
 
 
328 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.9 
 
 
339 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.66 
 
 
314 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  49.84 
 
 
328 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.32 
 
 
327 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.32 
 
 
325 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.32 
 
 
328 aa  291  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.46 
 
 
328 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  48.65 
 
 
325 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  51.17 
 
 
324 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.98 
 
 
328 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  47.78 
 
 
332 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  47.37 
 
 
335 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  48.33 
 
 
327 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.67 
 
 
330 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  49.17 
 
 
333 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  47.83 
 
 
322 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  49.67 
 
 
334 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.84 
 
 
333 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  46.31 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.27 
 
 
326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.33 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  47.83 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  46.2 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.99 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.69 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.64 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.64 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.49 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.6 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  49.33 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  46.98 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  46.64 
 
 
356 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  50.5 
 
 
335 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.83 
 
 
334 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.95 
 
 
304 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  46.1 
 
 
327 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.99 
 
 
323 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.62 
 
 
327 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  46.84 
 
 
336 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.71 
 
 
325 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.62 
 
 
333 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  48 
 
 
328 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.97 
 
 
322 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  45.72 
 
 
332 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.33 
 
 
339 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  48.03 
 
 
327 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.05 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  47.27 
 
 
322 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  47 
 
 
338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  41.84 
 
 
337 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.54 
 
 
325 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  47.59 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.4 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.4 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.69 
 
 
324 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  46.67 
 
 
343 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  44.63 
 
 
334 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  46.89 
 
 
335 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.82 
 
 
338 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.62 
 
 
326 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  48.05 
 
 
330 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.3 
 
 
334 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  49.5 
 
 
328 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  43.17 
 
 
331 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  45.32 
 
 
330 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  45.11 
 
 
331 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.6 
 
 
336 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.46 
 
 
330 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  46.84 
 
 
330 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  45.75 
 
 
336 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  45 
 
 
321 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  45.18 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.88 
 
 
356 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  44.58 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>