More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2999 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  63.21 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  56.42 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  55.7 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  56.27 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  50.49 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  49.35 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  48.68 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  48.83 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  45.42 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  49.21 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  48.68 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  45.17 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  50.34 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  46.39 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  46 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  50.34 
 
 		 322 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.51 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.38 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  45.54 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  46.76 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.22 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.89 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  44.59 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.42 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.59 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.15 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  46.01 
 
 		 327 aa  265  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.14 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.67 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.67 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.75 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.27 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.29 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.82 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.67 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.62 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.92 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.17 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.29 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.37 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  42.24 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43.37 
 
 		 343 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  40.5 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.72 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.44 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.51 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.37 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.83 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.18 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.21 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  40.92 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.35 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.18 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.37 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.35 
 
 		 356 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  44.3 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  41.27 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.65 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.6 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.47 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.65 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.82 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.71 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  38.87 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  40.81 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.53 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.91 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.21 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.03 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.4 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.56 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.75 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.53 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  38.41 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  44.41 
 
 		 386 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.81 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  42.54 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  43.51 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>