More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0795 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  64.55 
 
 
328 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.01 
 
 
328 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.01 
 
 
328 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.68 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.03 
 
 
325 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  44.31 
 
 
324 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46 
 
 
324 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43 
 
 
327 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43 
 
 
325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.94 
 
 
358 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.95 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.9 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.25 
 
 
336 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.82 
 
 
339 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.27 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.62 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.04 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.67 
 
 
324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  45.25 
 
 
324 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.46 
 
 
330 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.3 
 
 
304 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.01 
 
 
336 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.76 
 
 
327 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.85 
 
 
327 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 
330 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.85 
 
 
330 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.85 
 
 
330 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.37 
 
 
331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 
327 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.15 
 
 
338 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.34 
 
 
326 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  42.33 
 
 
325 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.07 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.49 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.48 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.49 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.94 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.47 
 
 
339 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.02 
 
 
328 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.11 
 
 
322 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.6 
 
 
333 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.76 
 
 
323 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 
349 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.33 
 
 
334 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  46.26 
 
 
330 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.14 
 
 
332 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41 
 
 
341 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.47 
 
 
330 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.33 
 
 
324 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.72 
 
 
325 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.8 
 
 
341 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.24 
 
 
322 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.52 
 
 
335 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.49 
 
 
325 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.86 
 
 
330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40.49 
 
 
325 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  42.37 
 
 
341 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  41.46 
 
 
319 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 
331 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.15 
 
 
324 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 
328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.64 
 
 
344 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
322 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.14 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.52 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  40.62 
 
 
326 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  41.53 
 
 
352 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  46.42 
 
 
349 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.33 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.62 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.42 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.45 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.07 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.12 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.64 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.72 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.02 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  43.38 
 
 
326 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.69 
 
 
331 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.33 
 
 
355 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43 
 
 
334 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.88 
 
 
322 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.94 
 
 
336 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40 
 
 
321 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 
335 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.63 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  41.02 
 
 
325 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.01 
 
 
326 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>