More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3703 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  72.14 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.9 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.58 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  41.72 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.22 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.28 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.55 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.19 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.64 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.48 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  44.59 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.02 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.77 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.92 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  44.08 
 
 		 328 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.47 
 
 		 335 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.67 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.97 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.67 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  43.52 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  46.26 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.61 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.57 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.48 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  41.04 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.55 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.37 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.33 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  45.94 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.07 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.3 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  43.54 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.72 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.67 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  42.37 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.14 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.96 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.28 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.73 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  40.91 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  45.76 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  41.79 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.36 
 
 		 331 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42 
 
 		 344 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.25 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.97 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.05 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  44.89 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.8 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.98 
 
 		 698 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.83 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.04 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  42.24 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.34 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  44.3 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  39.73 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.24 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.54 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.35 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  40.12 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.75 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.78 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.3 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.29 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.86 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  41.14 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.34 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.87 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.3 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.3 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.62 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  39.6 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.91 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.51 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>