More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4611 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  700    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  91.82 
 
 		 330 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  75.71 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  64.33 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  64.33 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  61.61 
 
 		 328 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  60.77 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  63.33 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  63.4 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  53.46 
 
 		 328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  57.19 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  57.76 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  51 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.99 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  45.74 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.3 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  41.64 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.46 
 
 		 322 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.96 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.22 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  40.24 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  42.11 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.91 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.47 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.51 
 
 		 335 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.48 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.33 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.81 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.33 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.75 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.33 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  44.48 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  44.48 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.38 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.59 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.47 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.6 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.91 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.39 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.81 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  41.67 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.15 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.8 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.15 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46.12 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  41.89 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.51 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.26 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.64 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  45.39 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.58 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.81 
 
 		 331 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.5 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.36 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.47 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.13 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.14 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.37 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.86 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.31 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  41.97 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.68 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  41.28 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.52 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  242  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.67 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.89 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  45.88 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.75 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.75 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.28 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.29 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.8 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.33 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  44.97 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  38.84 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.4 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.43 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  40.06 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.48 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>