More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3124 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  70.53 
 
 
327 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  46.71 
 
 
338 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  44.52 
 
 
325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  44.52 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  41.34 
 
 
328 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.68 
 
 
331 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  45.02 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  43.33 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.33 
 
 
335 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.45 
 
 
335 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.23 
 
 
328 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.42 
 
 
356 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.52 
 
 
333 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.69 
 
 
349 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.28 
 
 
332 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.45 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.72 
 
 
333 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.12 
 
 
327 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.36 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.88 
 
 
332 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  38.8 
 
 
338 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.76 
 
 
325 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  40.67 
 
 
320 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.31 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.4 
 
 
326 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.37 
 
 
331 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.32 
 
 
341 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.87 
 
 
327 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.58 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.07 
 
 
339 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 
328 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.06 
 
 
341 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.82 
 
 
325 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.79 
 
 
337 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.41 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.98 
 
 
331 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  41.31 
 
 
334 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.98 
 
 
331 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 
314 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.8 
 
 
328 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  37.31 
 
 
347 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 
328 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.58 
 
 
335 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 
328 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.18 
 
 
322 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.4 
 
 
323 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  35.56 
 
 
330 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.67 
 
 
325 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.67 
 
 
327 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.67 
 
 
333 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.23 
 
 
339 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.4 
 
 
341 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  42.05 
 
 
325 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  42.21 
 
 
322 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  39.31 
 
 
341 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.6 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.93 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.26 
 
 
332 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.88 
 
 
321 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  40.6 
 
 
323 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.93 
 
 
317 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.81 
 
 
318 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  40.94 
 
 
329 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  40.4 
 
 
327 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.94 
 
 
336 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  40.2 
 
 
326 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.91 
 
 
349 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  40.73 
 
 
337 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.54 
 
 
324 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.61 
 
 
330 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  40.13 
 
 
332 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.42 
 
 
328 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.16 
 
 
324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.18 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.53 
 
 
338 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.73 
 
 
325 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.8 
 
 
327 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.89 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.89 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  37.26 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  37.26 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.58 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.51 
 
 
330 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.51 
 
 
330 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.34 
 
 
345 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.23 
 
 
346 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.34 
 
 
345 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  36.11 
 
 
345 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 
322 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.4 
 
 
320 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.13 
 
 
323 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>