More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2463 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  69.54 
 
 
328 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  66.22 
 
 
328 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  51.25 
 
 
328 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  51.49 
 
 
330 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  51.16 
 
 
349 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  48.61 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  49.33 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  49.33 
 
 
325 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  48.26 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  46.34 
 
 
326 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  44.92 
 
 
320 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  48.52 
 
 
335 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  44.24 
 
 
327 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.14 
 
 
331 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  41.64 
 
 
340 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
326 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.82 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  44.91 
 
 
323 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  44.15 
 
 
332 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.14 
 
 
339 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.7 
 
 
328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.67 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.25 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.77 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.34 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  39.49 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.47 
 
 
323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.13 
 
 
331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  37.92 
 
 
322 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.3 
 
 
327 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.03 
 
 
337 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  38.08 
 
 
330 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.34 
 
 
328 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.34 
 
 
328 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 
328 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  38.2 
 
 
345 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.41 
 
 
333 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  38.59 
 
 
325 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.5 
 
 
335 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.58 
 
 
330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.39 
 
 
310 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.58 
 
 
330 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.38 
 
 
327 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.74 
 
 
332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.04 
 
 
326 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 
335 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  42.47 
 
 
321 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  37.21 
 
 
325 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.64 
 
 
323 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  46.1 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  40.54 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.31 
 
 
327 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  36.45 
 
 
331 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.97 
 
 
326 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.29 
 
 
318 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  225  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.41 
 
 
322 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  39.81 
 
 
331 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.92 
 
 
326 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  38.1 
 
 
326 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.57 
 
 
332 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.26 
 
 
327 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.26 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  35.49 
 
 
356 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.78 
 
 
331 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.47 
 
 
330 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.63 
 
 
349 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.42 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.43 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.81 
 
 
325 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 
329 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.46 
 
 
318 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  45.17 
 
 
325 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.47 
 
 
339 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.56 
 
 
346 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.13 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.46 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.78 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.5 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.81 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.25 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.74 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.27 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  39.57 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  37.96 
 
 
330 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  38.28 
 
 
325 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  39.86 
 
 
329 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  37.46 
 
 
338 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  38.87 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.99 
 
 
698 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.8 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.93 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.28 
 
 
325 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>