More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6179 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  56.17 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  56.17 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  49.69 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  48.55 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  46.42 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  44.79 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  41.77 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  43.97 
 
 		 325 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  41.53 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  42.72 
 
 		 336 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  39 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  40.13 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.73 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  40.36 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  38.94 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40.52 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  39.56 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.79 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.48 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.75 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.69 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.06 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.99 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.61 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.22 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.99 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.14 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.2 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  42.96 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  40.96 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  39.4 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.39 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.79 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.7 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  41.35 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.3 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  36.53 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.38 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  38.26 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.33 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.17 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.49 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.41 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.58 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  38.21 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  38.6 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.45 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.24 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  40.65 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.24 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  37.42 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  36.45 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.21 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  36.45 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  41.26 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.57 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.4 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  37.93 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.89 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  40.29 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.17 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.39 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.34 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.9 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  36.72 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.67 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.36 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.25 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.79 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.67 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  35.53 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.81 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.41 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.39 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.03 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.82 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.04 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  39.06 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.91 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.54 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.21 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.63 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.2 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.13 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.2 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  35.53 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.57 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>