More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0467 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  711    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  56.17 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  49.39 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  48.56 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  47.43 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  47.17 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  45.34 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  43.49 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  41.33 
 
 		 340 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  40.19 
 
 		 339 aa  242  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  39.24 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  40.57 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40.19 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.67 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  37.92 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.38 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.96 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  36.84 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  36.84 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  40.59 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.78 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.48 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.88 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  38.33 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.71 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  38.08 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.53 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.22 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.54 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  42.86 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  42.11 
 
 		 329 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.19 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.66 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  39.22 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.28 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.66 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  38.46 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.3 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.42 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.66 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.76 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  38.08 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.39 
 
 		 304 aa  209  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  37.79 
 
 		 326 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.51 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.58 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.09 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  38.33 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.08 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.26 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.39 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.8 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.56 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.06 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.83 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.43 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.65 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.96 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.03 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.37 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  41.26 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  38.91 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.83 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  41.45 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  39.34 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  36.86 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  38.89 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.27 
 
 		 320 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.67 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  35.5 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.19 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.8 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.93 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  37.45 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  40.78 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.28 
 
 		 325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.18 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.43 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  35.41 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.89 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>