More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4408 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 322 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  84.47 
 
 		 322 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  54.8 
 
 		 323 aa  361  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  47.43 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  47.43 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  46.42 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  46.84 
 
 		 325 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  44.27 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  43.95 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  44 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  42.24 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  36.72 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  37.5 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.72 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  38.72 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  38.94 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.37 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  38.87 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  40.33 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.72 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.58 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.75 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  41.41 
 
 		 355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  40.73 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.25 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.29 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.95 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.22 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.09 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.65 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.65 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.02 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.62 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.11 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.76 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  37.29 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.33 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.8 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.24 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.82 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.46 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.62 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.43 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.2 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.74 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  36.96 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.63 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  39.19 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  37.75 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.68 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  38.54 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  35.43 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.39 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.55 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.6 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  37.25 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.96 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.63 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.62 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.5 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.82 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  37.02 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.89 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.21 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  37.76 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  36.68 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.65 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.67 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  38.98 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  36.89 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.04 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  38.08 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  35.89 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.24 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.63 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.22 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  38.18 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.51 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.73 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>